簸上清酒於1700年代前半期，相傳是江戶時代中期的年號「正德」時期創立的。 當時的商號是「富田屋」。 在漫長的歷史中曾多次遭到大火襲擊。雖然沒有留下詳細的記錄，但據說所在地自古以來便是釀酒業興盛的地區，同一個郡內，包括本藏共有五家釀酒廠。

第十二代藏主權次郎時期，1895年頒佈了釀酒許可制，1910年町內的三家酒藏合併， 成為了現在的「簸上清酒合名会社」。 本藏的「簸上正宗」是從這個時候開始持續至今的品牌，長年受到當地客人的喜愛。 

1960年代，第十四代藏主田村浩三在釀造中發現了泡無酵母菌的原種。 為日本酒的製造技術的發展做出了巨大貢獻。1966年，因為原本的酒藏距離斐伊川很近，當時的河流寬度和深度都沒有現在那麼深，所以經常遭受洪水災害。 為了保持穩定的釀酒環境，酒藏從原本的橫田町六日市（現在的奧出雲町）轉移到了現在的所在地。